Substancje stałe i zmętnienia, które powstają w wyniku flokulacji, mogą być wyizolowane poprzez sedymentację. W tym procesie, jakość wody jest monitorowana poprzez pomiar jej konduktywności i wartości pH. Jeśli wartość pH jest zoptymalizowana do flokulacji materiałów organicznych i nieorganicznych, jest ona ponownie regulowana po separacji i przed filtracją.